(Diminutivo latino de habena que significa rienda).

Inicialmente designó el tallo o tronco de la glándula pineal, siendo la habénula pineal, o pedúnculo del cuerpo pineal, pero gradualmente pasó a referirse al grupo cercano de células nerviosas con las que se cree que está asociada la glándula pineal.

El núcleo habenular es un conjunto de estructuras bien conservadas en todos los vertebrados. Actualmente, el término de Terminologia Anatomica se refiere exclusivamente a esta mása de células situada en el aspecto dorsal y caudal del tálamo (el epitálamo, incluida en el extremo posterior de la stria medularis, de la cual recibe la mayor parte de sus fibras aferentes. Por el fascículo retroflejo (tracto habénulo- interpeduncular) se proyecta en el núcleo interpeduncular y otros grupos de células paramediales del tegmento del cerebro medio.

La habénula recibe aferencias del cerebro por la estría medular talámica y eferencias a muchas áreas del cerebro medio implicadas en la liberación de neuromoduladores como la dopamina, norepinefrina y serotonina.