Meduloblastoma con un grado de atipia más pronunciado y de peor pronóstico.
La deleción 17p y el isocromosoma 17 son más frecuentes en las variantes anaplásica y clásica y menos en la desmoplásica.
Las alteraciones genéticas de amplificación de C-myc y Nmyc se considera muy desfavorable y suele asociarse a esta variante.
Se ha descrito que la heterogeneidad de senal tumoral en T2 asociada a realce con patrón «en panal» detecta la variante anaplásica del meduloblastoma con sensibilidad del 100% aunque con menor especificidad.